El Museo está ubicado en la zona de la antigua ciudad en una construcción colonial del S. XVIII restaurada y acondicionados sus espacios interiores en función del destino que se le iba a asignar como sede del museo. Para estar a la altura de las exigencias educativas, teóricas y prácticas que nos planteaba la responsabilidad de un Museo de Ambar, se eligió al Dr. Abelardo Jiménez Lambertus, reconocido especialista estudioso de la materia y Director del Museo de Historia Natural de Santo Domingo, para la elaboración del guion museográfico y de los textos que acompañan la exhibición.